Kontorets hovedopgaver er:
- Medicinområdet og nye behandlinger
- Den regionale lægemiddelkomité
- Medicindata
- Analyse og tværgående optimering af kapaciteten på regionens hospitaler
- Udvidet frit valg og udbud i forhold til privathospitaler
- Patientrettigheder og ret til hurtig udredning og behandling
- Fælles visitationer
- Samarbejdsaftaler på tværs af regioner/andre lande
- Hospitalsbyggerier i somatikken og psykiatrien, herunder kvalitetsfondsprojekterne i Aarhus, Gødstrup og Viborg
- Ombygning af eksisterende hospitaler
- Investeringsplaner på anlægsområdet
- Designguides til byggerier
- Koordinering og prioritering af medicotekniske anskaffelser
- Afdelingens økonomi
- Vacciner